Научный журнал
Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований

ISSN 1996-3955
ИФ РИНЦ = 0,580

КОЛОНИЗАЦИЯ ACINETOBACTER BAUMANNII – ПРОДУЦЕНТА ОХА-КАРБАПЕНЕМАЗ СЛИЗИСТОЙ ОБОЛОЧКИ РОТОГЛОТКИ И ПРЯМОЙ КИШКИ СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ ОНКОЛОГИЧЕСКОГО СТАЦИОНАРА

Кит О.И. 2 Маслов А.А. 2 Зыкова Т.А. 2 Савочкина Ю.А. 1 Туманян С.В. 2 Богомолова О.А. 2 Шульга А.В. 2
1 ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
2 Ростовский научно-исследовательский онкологический институт Министерства здравоохранения Российской Федерации
В работе представлены результаты исследований клинического материала (мазки со слизистой ротоглотки и прямой кишки), взятого в первые сутки поступления в онкологический стационар. Определяли наличие ДНК A. baumannii и генов ОХА-карабапенемаз (ОХА-51, ОХА-23, ОХА-40, ОХА-58). Установлен высокий уровень колонизации пациентов онкологического стационара A. baumannii (20,0 %), в том числе несущими генетические детерминанты резистентности к карбапенемам (35,9 %). Установлены различия в уровне колонизации слизистой ротоглотки (12,2 %) и прямой кишки (8,0 %), а также уровнем колонизации пациентов с различной локализацией опухолевого процесса. Прямое определение ДНК A. baumannii и генов ОХА-карбапенемаз в клиническом материале с использованием метода ПЦР в реальном времени может быть рекомендовано для определения тактики эмпирической терапии.
A. baumannii
карбапенемазы
колонизация слизистых оболочек
гены резистентности
ПЦР в реальном времени
1. Национальная концепция профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи-Роспотребнадзор, 2011. http://rospotrebnadzor.ru.
2. Fournier P.E., Vallenet D., Barbe V. et al. Comparative genomics of multidrug resistance in Acinetobacter baumannii. PLOS Genet. – 2006. – № 2 (1). – P. 62–72.
3. Marioni G., Marchese-Ragona R., Boldrin C. et al. Deep neck abscess due to Acinetobacter baumannii infection. Am J Otolaryngol. – 2010. – № 31 (4). – P. 304–307.
4. Рябкова Е.Л., Иванчик Н.В., Сухорукова М.В. Резистентность нозокомиальных штаммов Escherichia coli в стационарах России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2009. – Т. 11. № 2. – С. 161–169.
5. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Скленова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФРН в 2011-2012гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2014. – Т. 16. № 4. – С. 266–272.
6. Воробьева О.Н., Камалеева М.Ф., Жилина Н.М., Чеченин Г.И., Челпанова Л.И. Этиологическая структура нозокомиальных инфекций у больных в отделении реанимации и интенсивной терапии. Российский медикобиологический вестник им. акад. И.П. Павлова. – 2009. – № 1. – С. 33–38.
7. Фаращук А.Н. Оптимизация антибиотикотерапии нозокомиальных инфекций, вызванных Acinetobacter baumannii, в отделениях реанимации и интенсивной терапии России: Дисс. – Смоленск; 2008.
8. Светличная Ю.С. Распространение карбапенемустойчивых штаммов A. baumannii в многопрофильных стационарах Санкт-Петербурга. Медицинский альманах. – 2015. – № 5 (40). – С. 102–105.
9. Городинская Н.А., Сабирова Е.В., Абрамова Н.В., Капасева Г.Н., Некаева Е.С. Антибиотикочувствительность и молекулярные механизмы резистентности Acinetobacter baumannii, возбудителей раневой ожоговой инфекции // Медицинский альманах. – 2015. – № 5 (40). – С. 99–101.
10. Григорьевская З.В., Дмитриева Н.В., Петухова И.Н., Дьякова С.А. Особенности течения инфекционных осложнений, вызванных панрезистентными Acinetobacter baumannii у онкологических больных // Сибирский онкологический журнал. – 2011. – № 6 (48). – С. 14–18.
11. Мартинович А.А. Динамика антибиотикорезистентности и эпидемиология инфекций, вызванных Acinetobacter spp., в России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2010. – Т. 12. № 2. – С. 96–103.
12. Горбич Ю.Л. Инфекции, вызываемые Acinetobacter baumannii, и их рациональная антибактериальная терапия: Дисс. – Минск; 2012.
13. Зыкова Т.А. Богомолова О.А., Панова Н.И., Малейко М.Л., Бут О.А. Выявление генов ОХА-карбапенемаз у изолятов Acinetobacter baumannii, выделенных в стационарах Ростова-на-Дону. В книге: Молекулярная диагностика – 2014. Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. Под редакцией В.И. Покровского. – 2014. – С. 273.
14. Зыкова Т.А., Богомолова О.А. Определение генов резистентности у грамотрицательных бактерий молекулярными методами // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2014. – Т. 16. № 2. Приложение 1. – С. 21.
15. Зыкова Т.А., Богомолова О.А. Возможности молекулярных методов в программах эпидемиологического скрининга // Проблемы медицинской микологии. – 2015. – Т. 17. № 2. – С. 75–76.
16. Лазарева А.В., Катосова Л.К., Крыжановская О.А., Пономаренко О.А., Карасева О.В., Горелик А.Л., Маянский Н.А. Мониторинг и профиль антибиотикорезистентности микробиоты трахеально аспирата у детей с тяжелой черепно-мозговой травмой в отделении реанимации и интенсивной терапии // Антибиотики и химиотерапия. – 2014. – Т. 59. № 7-8. – С. 8–15.
17. Горбич Ю.Л., Карпов И.А., Кречикова О.И. Оценка значимости Acinetobacter baumannii для клинического исхода заболевания у пациентов с ацинетобактер-ассоциированными инфекциями // Медицинская панорама. – 2011. – № 6. – С. 73–77.
18. Зыкова Т.А., Туманян С.В., Богомолова О.А., Панова Н.И. Этиология пневмоний в онкологическом стационаре // Проблемы медицинской микологии. – 2015. – Т. 17, № 2. – С. 76.

Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи, выявляют у 5-10 % пациентов, находящихся в стационаре [1]. И, если ранее, наиболее частыми возбудителями нозокомиальных инфекций (НИ) были грамположительные бактерии, то в последние десятилетия в их структуре преобладают грамотрицательные микроорганизмы. В этой ситуации особую тревогу вызывает неуклонный рост числа НИ, вызванных неферментирующими грамотрицательными микроорганизмами, в том числе бактериями рода Acinetobacter. В Европе и США A. baumannii является этиологическим агентом 2-10 % всех грамотрицательных инфекций [2] и до 1 % всех НИ [3]. В 2006-2008 гг. A. baumannii в России был третьим по частоте (15,3 %) грамотрицательным возбудителем НИ [4], а по результатам многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН России в 2011-2012 гг. этот возбудитель составил 13,9 % из всех выделенных бактериальных возбудителей [5].

По данным ряда авторов в стационарах городов России A. baumannii достигает 15,5-39,8 % в спектре грамотрицательных возбудителей [6,7]. В многопрофильных стационарах Санкт-Петербурга доля карбапенемустойчивых штаммов A. baumannii в 2010-2014 гг. составила 41,4 % к меропенему, 47,5 % к имипенему и 34,3 % к меропенему и имипенему [8]. Среди возбудителей раневой ожоговой инфекции к бактериям рода Acinetobacter принадлежало 13,3 % микроорганизмов [9]. По данным РОНЦ им. Н.Н. Блохина частота выделения A. baumannii в общей структуре микроорганизмов возросла от 2,5 % в 2005г до 9,7 % в 2010 г. [10].

Особую тревогу вызывает быстрое распространение практически во всех странах мультирезистентных штаммов A. baumannii, что значительно ухудшает результаты и сокращает возможности лечения инфекций, вызванных этим возбудителем. В РОНЦ им. Н.Н. Блохина в 2010 г. PDR штаммы A. baumannii были выделены в 40,7 % случаев [10].

Наиболее эффективным и эпидемиологически значимым механизмом резистентности у нозокомиальных штаммов A. baumannii является продукция приобретенных карбапенем-гидролизующих β-лактамаз класса D (CHDL): ОХА-23, ОХА-40, ОХА-58-подобных, а также металло-β-лактамаз, таких как INB и VIM. Распространенность этих ферментов в разных странах существенно отличается [11]. Продукция карбапенемаз в России в настоящее время отмечается у 44 % госпитальных изолятов A. baumannii. Особое опасение вызывает стремительное распространение на всей территории России штаммов A. baumannii, продуцирующих карбапенемазы группы ОХА-24/40, доля которых в 2011-2012гг составила 35,7 % [5]. ОХА-продуцирующие A. baumannii были получены из Иркутска (ОХА-23), Новосибирска (ОХА-58), Москвы (ОХА-23 и 58) [11]. Преимущественная циркуляция ОХА-40-подобных карбапенемаз (85,2 %) была отмечена в Минске [12] и Ростове-на-Дону [13]. В последнем случае ОХА-40 карбапенемазы преобладали среди онкологических больных [14, 15]. A. baumannii был выделен у 27-37 % пациентов, 78 % выделенных культур были карбапенемрезистеными, доминировала карбапенемаза ОХА-40 (97 %) [16]. Было показано, что колонизация слизистых оболочек верхних дыхательных путей возбудителями госпитальных инфекций у детей с тяжелой черепно-мозговой травмой, находящихся в ОРИТ происходила после 4 дня госпитализации [16].

В свете изложенного нам представилось интересным изучить наличие колонизации A. baumannii пациентов с онкологической патологией еще до поступления в стационар, ведь A. baumannii является фактором, оказывающим влияние на исход заболевания [12, 17]. Клиническими факторами риска колонизации и/или инфицирования карбапенемрезистеными A. baumannii являются предшествующая терапия, включая глюкокортикостероиды, «антисинегнойные» карбапенемы, проведение ИВЛ, выполнение катетеризации центральной и/или периферической вены и мочевыводящих путей, госпитализация в ОРИТ [12], а все эти факторы присутствуют у пациентов онкологических стационаров.

Целью настоящего исследования является изучение частоты колонизации слизистой оболочки кишечника и ротоглотки A. baumannii, продуцирующими ОХА-карбапенемазы, среди больных с солидными опухолями.

Материалы и методы исследования

Исследование проводили среди больных, госпитализированных в клинику ФГБУ «РНИОИ» Минздрава России в период с июля по август 2015 г. Исследовали мазки со слизистой оболочки ротоглотки и прямой кишки, полученные в первые сутки нахождения в стационаре (до проведения оперативного вмешательства).

Мазки отбирали в специальную транспортную среду, представляющую собой раствор фосфатного буфера с добавлением консерванта.

ДНК выделяли методом сорбции на частицах силики. Выявление генов ОХА-карбапенемаз (групп ОХА-23 ОХА-58 и ОХА-40) и видоспецифических β-лактамаз A. baumannii (ген ОХА-51), генов металло-β-лактамаз групп VIM, IMP, NDM осуществляли методом мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме «реального времени». Использовали наборы реагентов, разработанные в ФБУН ЦНИИЭ.

Всего было обследовано 230 пациентов, исследовано 368 образцов, в том числе 230 мазков из ротоглотки и 138 из прямой кишки.

Результаты исследования и их обсуждение

Молекулярный маркер A. baumannii (ген ОХА-51) был обнаружен у 39 (20,0 %) больных, в том числе у 28 (12,2 %) в мазках со слизистой ротоглотки, 11 (8,0 %) в мазках со слизистой прямой кишки. Ни у одного больного ген ОХА-51 не был обнаружен в двух локусах.

Различные гены ОХА-карбапенемаз были выявлены у 14 больных (6,1 % из числа обследованных и 35,9 % из колонизированных A. baumannii), в том числе в мазках из зева у 13 (5,7 % из обследованных и 46,4 % из колонизированных A. baumannii), в ректальных мазках у одного (0,7 % из обследованных и 25,6 % из от колонизированных A. baumannii). Гены металло-β-лактамаз групп VIM, IMP, NDM не были обнаружены ни в одном случае.

В проведенном ранее исследовании было показано, что в этиологической структуре пневмоний у онкологических больных преобладали A. baumannii (45,8 % от всех грамотрицательных возбудителей). Абсолютное большинство из них имели ген ОХА-40-подобных карбапенемаз [18]. Эти данные полностью коррелируют с полученной в настоящем исследовании информации о преимущественной колонизации A. baumannii, несущими генетические детерминанты резистентности к карбапенемам (ОХА-40), слизистой ротоглотки по сравнению со слизистой прямой кишки.

Чрезвычайно интересным представляется тот факт, что ДНК ОХА-карбапенемаз была обнаружена не только в образцах с молекулярным маркером A. baumannii (ОХА-51), но и в образцах без него. Ранее нами было показано обнаружение гена ОХА-40 в изоляте A. towneri, выделенном из внешней среды стационара [13]. Можно предположить, что штаммы Acinetobacter spp., циркулирующие во внешней среде, служат резервуаром генов ОХА-карбапенемаз. В этом случае, Acinetobacter spp., несущие гены ОХА-карбапенемаз, при определенных условиях и реализации горизонтального переноса генов карбапенемаз, могут стать источником эпидемического неблагополучия в стационаре.

В целом, с учетом всех образцов клинического материала, имеющих ген ОХА-51 и без него, различные генетические детерминанты резистентности (ОХА-23, ОХА-40 или ОХА-58) были обнаружены у 50 больных (21,7 % от числа обследованных). В материале из ротоглотки гены ОХА-карбапенемаз были обнаружены у 37 из 230 больных (16,1 %), в ректальных мазках у 10 из 138 (7,2 %), одновременно в ротоглотке и прямой кишке у 3 (2,2 %). Менее 1 % больных были носителями двух генов одновременно (ОХА-40 и 58). Всего с учетом mixt ген карбапенемазы ОХА-23 был обнаружен у 5 пациентов (2,2 %), ОХА-40 у 22 пациентов (9,6 %), ген ОХА-58 у 25 пациентов (10,9 %). Таким образом, гены ОХА-40 и ОХА-58 были распространены среди поступающих на оперативное лечение пациентов одинаково часто. При исследовании культур A. baumanii, изолированных из клинического материала при возникновении инфекционных осложнений, так же преимущественно был обнаружен ген ОХА-40 карбапенемаз [14].

При анализе частоты выявления ОХА-карбапенемаз среди больных с различной локализацией опухолевого процесса было установлено, что ОХА-40 чаще выявлялись при абдоминальной патологии (14,9 %), ОХА-58 при патологии мягких тканей/молочной железы (12,5 %) и женских репродуктивных органов (22,7 %). При этом было отмечено, что ОХА-58 чаще были обнаружены в образцах без молекулярного маркера A. baumannii, а ОХА-40 – с ним. Пока неясно, имеют ли эти данные клиническое значение или являются отражением эпидемической ситуации в конкретном стационаре.

Таблица 1

Частота выявления генов ОХА-карбапенемаз A. baumannii (ОХА-51+) в различных локусах

Гены ОХА-карьапенемаз

Мазки из ротоглотки

Ректальные мазки

Всего больных

Абс.

% от обследованных (n = 230)

% от A. baumannii (n = 28)

Абс.

% от обследованных (n = 138)

% от A. baumannii (n = 11)

Абс.

% от обследованных (n = 230)

% от A. baumannii (n = 39)

ОХА-23

2

0,9

7,1

0

0,0

0,0

2

0,9

5,1

ОХА-40

7

3,0

25,0

1

0,7

9,1

8

3,5

20,5

ОХА-58

4

1,7

14,3

0

0,0

0,0

4

1,7

10,3

Всего

13

5,7

46,4

1

0,7

9,1

14

6,1

35,9

Таблица 2

Частота выявления генов ОХА-карбапенемаз Acinetobacter spp. у онкологических больных

Гены ОХА-карбапенемаз

Мазки из зева

(n = 230)

Ректальные мазки (n = 138)

Оба локуса

(n = 138)

Всего больных (n = 230)

абс

%

абс

%

абс

%

абс

%

ОХА-23

4

1,7

0

0

0

0

4

1,7

ОХА-40

18

7,8

2

1,4

1

0,7

21

9,1

ОХА-58

13

5,7

8

5,8

2

1,4

23

10,0

ОХА40+58

1

0,43

0

0

0

0

1

0,4

ОХА23+58

1

0,43

0

0

0

0

1

0,4

Всего

37

16,1

10

7,2

3

2,2

50

21,7

При дальнейшем наблюдении за больными, осуществленном в рамках настоящего исследования, в послеоперационном периоде не были зарегистрированы бактериемия или осложнения, вызванные A. baumannii. В то же время, мы считаем, что детекция бессимптомного носительства возбудителей – продуцентов карбапенемаз с использованием ПЦР-РВ в дальнейшем может стать эффективным инструментом профилактики развития послеоперационных осложнений, особенно у иммунокомпроментированных пациентов.

Выводы

1. 20,0 % онкологических больных при поступлении в хирургический стационар уже были колонизированы A. baumannii. Слизистая ротоглотки была колонизирована у 12,2 %, слизистая прямой кишки у 8,0 % больных.

2. Гены ОХА-карбапенемаз были выявлены у 6,1 % больных из числа обследованных и 35,9 % из числа колонизированных A. baumannii.

3. Штаммы Acinetobacter spp., циркулирующие во внешней среде могут служить резервуаром генов ОХА-карбапенемаз.

4. Прямое определение ДНК A. baumannii и генов ОХА-карбапенемаз с использованием метода ПЦР в реальном времени может быть рекомендовано для подбора адекватной эмпирической терапии в случае возникновения инфекционных осложнений.


Библиографическая ссылка

Кит О.И., Маслов А.А., Зыкова Т.А., Савочкина Ю.А., Туманян С.В., Богомолова О.А., Шульга А.В. КОЛОНИЗАЦИЯ ACINETOBACTER BAUMANNII – ПРОДУЦЕНТА ОХА-КАРБАПЕНЕМАЗ СЛИЗИСТОЙ ОБОЛОЧКИ РОТОГЛОТКИ И ПРЯМОЙ КИШКИ СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ ОНКОЛОГИЧЕСКОГО СТАЦИОНАРА // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. – 2016. – № 9-2. – С. 214-217;
URL: https://www.applied-research.ru/ru/article/view?id=10221 (дата обращения: 28.01.2021).

Предлагаем вашему вниманию журналы, издающиеся в издательстве «Академия Естествознания»
(Высокий импакт-фактор РИНЦ, тематика журналов охватывает все научные направления)

«Фундаментальные исследования» список ВАК ИФ РИНЦ = 1.074